東京奧運開幕距今尚餘不足100日，去年因新型冠狀病毒肆虐，史上首度延期，即使東京奧組委早前已宣布不會接待海外觀眾，本屆奧運仍須面對前所未有的防疫挑戰。奧運會史上，防疫問題非新鮮事，近代亦有奧運會在舉行期間遇上傳染病疫情，甚至在奧運會內出現感染。
2016年里約熱內盧奧運—寨卡病毒
寨卡病毒2015年至2016年期間肆虐拉丁美洲，主辦2016年里約奧運的巴西更成疫情重災區，據巴西衛生部資料，該國單在2016年1月至4月便錄得超過17萬人受感染。世衛在2016年2月宣布寨卡疫情為國際公共衛生緊急事件，令人關注奧運會及殘奧會能否如期在里約舉行。世衛最終發出指引，認為奧運取消或移師其他地方舉行都不會對寨卡傳播有顯著改變，建議前往奧運的人遵從旅行建議，包括選擇配備冷氣的住宿、穿淺色及覆蓋身體大部分的衣服等。
不過，該屆奧運最終仍有10多名運動員以寨卡疫情為由放棄征戰，包括高爾夫名將戴伊（Jason Day）及麥伊萊（Rory McIlroy）；網球的拉奧歷（Milos Raonic）、夏納（Simona Halep）等。
2010年溫哥華冬季奧運—H1N1流感（豬流感）
豬流感在2009年至2010在世界各地大流行，世衛資料顯示，疫情最少導致49萬人受感染。世衛在溫哥華冬奧前，亦派出代表監察當地疫情的潛在爆發。而在各款豬流感疫苗相繼面世下，該屆奧組委鼓勵職員及義工接種疫苗，卑詩省政府在冬奧時，更免費向各國運動員、職員、甚至旅客提供疫苗接種。
1998年長野冬季奧運—流感
要數奧運少數防疫失敗的例子，就要提到1998年日本長野冬奧。當屆冬奧遇上日本流感大爆發，全國近90萬人染疫。有運動員在生病的情況下選擇繼續作賽，亦有人不勝病情選擇退賽。有運動者因選手村內有很多人生病，改住酒店。該屆的醫療總監奧康敬當時稱，最少70人因出現傷風感冒病徵到奧運村的診所求醫。