政府今日（3日）下午宣布只保留機場、深圳灣口岸和港珠澳大橋香港口岸可以出入境，以盡量減少出入境人流。港鐵宣布，今晚東鐵線來往羅湖或落馬洲站的尾班車不受影響，羅湖及落馬洲站於明日起暫時關閉，東鐵線列車服務維持來往紅磡至上水站。有經常往來中港兩地的市民認為，港府沒有必要封關，封關亦未必可阻止疫情擴散，反而會帶來不便。
港鐵表示，封關前的羅湖尾班車將於今晚11時07分於紅磡開出，以及明日（4日）凌晨零時30分於羅湖開出；至於落馬洲尾班車則於晚上9時35分於紅磡開出，以及晚上10時55分於落馬洲開出。港鐵明日起會提供接駁列車，往來上水至羅湖站，每30分鐘一班車，只接載羅湖居民，車站職員會在月台協助乘客。